我國科學(xué)家開發(fā)高通量空間成像技術(shù)解析微生物群落空間結(jié)構(gòu)

日期： 2023年04月13日　10:14 來源：科技部生物中心  　　

植物根部有著密密麻麻的微生物群落，這些微生物和植物的生長息息相關(guān)，形成了一個復(fù)雜而精彩的生態(tài)系統(tǒng)。盡管在目前的認(rèn)知中，熒光原位雜交技術(shù)可用于微生物的可視化，但傳統(tǒng)的成像方法受到熒光基團(tuán)光譜重疊的限制，能同時(shí)表征的物種豐富度有限。因此，需要發(fā)展新的微生物成像技術(shù)，以更好地表征和解析微生物群落的空間結(jié)構(gòu)�！　�

近期，中科院深圳先進(jìn)院合成生物學(xué)研究所團(tuán)隊(duì)成功開發(fā)可容錯編碼的序貫熒光原位雜交（sequential error-robust fluorescence in situ hybridization，SEER-FISH）技術(shù)，該方法可識別復(fù)雜群落中的不同微生物物種，在單細(xì)胞尺度上原位解析微生物物種之間以及微生物-宿主之間的相互作用，進(jìn)而研究其生態(tài)規(guī)律和生理功能；在微米尺度上繪制了擬南芥根系定植的多細(xì)菌物種的生物地理分布，觀測到不同微生物物種在根系上的空間異質(zhì)性定植，以及在受到宿主代謝物擾動后微生物的空間分布變化和物種空間關(guān)聯(lián)改變。相關(guān)研究成果在《Nature Communications》雜志上，題為“Spatial profiling of microbial communities by sequential FISH with error-robust encoding”�！　�

總體來說，SEER-FISH技術(shù)拓展了熒光分子的種類與雜交成像輪數(shù)之間的指數(shù)組合，從而實(shí)現(xiàn)對微生物群的全部物種的同時(shí)成像。這一成果為進(jìn)一步研究微生物群落的結(jié)構(gòu)和生態(tài)系統(tǒng)提供了新的可能性，是研究微生物群落的生態(tài)和功能的重要工具�！　�

注：此研究成果摘自《Nature Communications》雜志，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點(diǎn)和立場，僅供參考。